MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755 plasmid pLM1-2bUG1

Total Repeats: 1383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014495	A	7	7	17	23	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014495	TTTCCT	2	12	116	127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069351
3	NC_014495	AGGG	2	8	166	173	25 %	0 %	75 %	0 %	307069351
4	NC_014495	T	6	6	183	188	0 %	100 %	0 %	0 %	307069351
5	NC_014495	AG	3	6	214	219	50 %	0 %	50 %	0 %	307069351
6	NC_014495	GA	3	6	220	225	50 %	0 %	50 %	0 %	307069351
7	NC_014495	AGC	2	6	263	268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069351
8	NC_014495	AGC	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069351
9	NC_014495	AAG	2	6	462	467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069351
10	NC_014495	GCT	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307069351
11	NC_014495	CAA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069351
12	NC_014495	GTCGAT	2	12	602	613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307069351
13	NC_014495	ACA	2	6	616	621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069351
14	NC_014495	TTTTA	2	10	679	688	20 %	80 %	0 %	0 %	307069351
15	NC_014495	TAC	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069351
16	NC_014495	CGAA	2	8	813	820	50 %	0 %	25 %	25 %	307069351
17	NC_014495	TTC	2	6	857	862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069351
18	NC_014495	CTT	2	6	889	894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069351
19	NC_014495	ATTTCA	2	12	910	921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307069351
20	NC_014495	TGA	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069351
21	NC_014495	AAT	2	6	959	964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069351
22	NC_014495	AAGC	2	8	989	996	50 %	0 %	25 %	25 %	307069351
23	NC_014495	GCA	2	6	1015	1020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069351
24	NC_014495	ATGTT	2	10	1089	1098	20 %	60 %	20 %	0 %	307069351
25	NC_014495	CTTG	2	8	1109	1116	0 %	50 %	25 %	25 %	307069351
26	NC_014495	CTGAA	2	10	1185	1194	40 %	20 %	20 %	20 %	307069351
27	NC_014495	GT	3	6	1350	1355	0 %	50 %	50 %	0 %	307069351
28	NC_014495	A	6	6	1367	1372	100 %	0 %	0 %	0 %	307069351
29	NC_014495	GAA	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069351
30	NC_014495	A	6	6	1523	1528	100 %	0 %	0 %	0 %	307069351
31	NC_014495	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069351
32	NC_014495	A	8	8	1647	1654	100 %	0 %	0 %	0 %	307069351
33	NC_014495	TTG	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307069351
34	NC_014495	CAG	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069351
35	NC_014495	AG	3	6	1744	1749	50 %	0 %	50 %	0 %	307069351
36	NC_014495	AGT	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069351
37	NC_014495	AATT	2	8	1934	1941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014495	ACA	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069352
39	NC_014495	ATG	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069352
40	NC_014495	ACC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014495	A	8	8	2147	2154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014495	A	6	6	2160	2165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014495	TCA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014495	TAT	3	9	2406	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069353
45	NC_014495	TGGA	2	8	2524	2531	25 %	25 %	50 %	0 %	307069353
46	NC_014495	AGT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069353
47	NC_014495	TTA	2	6	2583	2588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069353
48	NC_014495	TGG	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307069353
49	NC_014495	AAT	2	6	2673	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069353
50	NC_014495	GAA	2	6	2726	2731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069353
51	NC_014495	ATT	2	6	2747	2752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069353
52	NC_014495	GTAT	2	8	2788	2795	25 %	50 %	25 %	0 %	307069353
53	NC_014495	AAG	2	6	2815	2820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069353
54	NC_014495	T	6	6	2844	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	307069353
55	NC_014495	TTG	2	6	2862	2867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307069353
56	NC_014495	A	6	6	2917	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014495	GAA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069354
58	NC_014495	AAG	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069354
59	NC_014495	CTT	2	6	3050	3055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069354
60	NC_014495	CGA	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069354
61	NC_014495	TTC	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069354
62	NC_014495	TTC	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069354
63	NC_014495	AAAG	2	8	3105	3112	75 %	0 %	25 %	0 %	307069354
64	NC_014495	GCTC	2	8	3268	3275	0 %	25 %	25 %	50 %	307069354
65	NC_014495	GA	3	6	3338	3343	50 %	0 %	50 %	0 %	307069354
66	NC_014495	T	7	7	3378	3384	0 %	100 %	0 %	0 %	307069354
67	NC_014495	AGA	2	6	3468	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069354
68	NC_014495	CTT	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069355
69	NC_014495	TTTC	2	8	3785	3792	0 %	75 %	0 %	25 %	307069355
70	NC_014495	AAGT	2	8	3817	3824	50 %	25 %	25 %	0 %	307069355
71	NC_014495	CTT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069355
72	NC_014495	TCG	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307069355
73	NC_014495	T	7	7	3892	3898	0 %	100 %	0 %	0 %	307069355
74	NC_014495	AACA	2	8	3968	3975	75 %	0 %	0 %	25 %	307069355
75	NC_014495	CGAT	2	8	3986	3993	25 %	25 %	25 %	25 %	307069355
76	NC_014495	TAA	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069355
77	NC_014495	CTT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069355
78	NC_014495	T	6	6	4112	4117	0 %	100 %	0 %	0 %	307069355
79	NC_014495	T	7	7	4190	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	307069355
80	NC_014495	CTTT	2	8	4199	4206	0 %	75 %	0 %	25 %	307069355
81	NC_014495	T	6	6	4204	4209	0 %	100 %	0 %	0 %	307069355
82	NC_014495	TTG	2	6	4225	4230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307069355
83	NC_014495	TTTC	2	8	4302	4309	0 %	75 %	0 %	25 %	307069355
84	NC_014495	AATTC	2	10	4320	4329	40 %	40 %	0 %	20 %	307069355
85	NC_014495	CAT	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069355
86	NC_014495	TCC	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014495	ATC	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069356
88	NC_014495	TTC	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069356
89	NC_014495	TCT	2	6	4431	4436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069356
90	NC_014495	CAAA	2	8	4542	4549	75 %	0 %	0 %	25 %	307069356
91	NC_014495	CTT	2	6	4579	4584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069356
92	NC_014495	AT	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	307069356
93	NC_014495	GATG	2	8	4702	4709	25 %	25 %	50 %	0 %	307069356
94	NC_014495	TGT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307069356
95	NC_014495	AT	3	6	4802	4807	50 %	50 %	0 %	0 %	307069356
96	NC_014495	TTTG	2	8	4896	4903	0 %	75 %	25 %	0 %	307069356
97	NC_014495	GAC	2	6	4915	4920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069356
98	NC_014495	TG	3	6	4983	4988	0 %	50 %	50 %	0 %	307069356
99	NC_014495	TAC	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069356
100	NC_014495	TG	3	6	5212	5217	0 %	50 %	50 %	0 %	307069357
101	NC_014495	TAC	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069357
102	NC_014495	TTTC	2	8	5441	5448	0 %	75 %	0 %	25 %	307069357
103	NC_014495	TTC	2	6	5511	5516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069357
104	NC_014495	T	6	6	5568	5573	0 %	100 %	0 %	0 %	307069357
105	NC_014495	AAT	2	6	5628	5633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069357
106	NC_014495	TTC	2	6	5634	5639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069357
107	NC_014495	AGG	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307069357
108	NC_014495	TC	4	8	5673	5680	0 %	50 %	0 %	50 %	307069357
109	NC_014495	ATA	2	6	5715	5720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069357
110	NC_014495	TCAT	2	8	5785	5792	25 %	50 %	0 %	25 %	307069357
111	NC_014495	GTA	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069357
112	NC_014495	GAA	2	6	5956	5961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014495	CAAG	2	8	6064	6071	50 %	0 %	25 %	25 %	307069358
114	NC_014495	ATTA	2	8	6082	6089	50 %	50 %	0 %	0 %	307069358
115	NC_014495	ATAA	2	8	6097	6104	75 %	25 %	0 %	0 %	307069358
116	NC_014495	TTA	2	6	6168	6173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014495	ACA	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014495	ATT	2	6	6232	6237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014495	T	6	6	6246	6251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014495	AG	4	8	6284	6291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014495	A	7	7	6298	6304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014495	GAA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014495	AGAA	2	8	6351	6358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014495	TGA	2	6	6372	6377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069359
125	NC_014495	A	7	7	6386	6392	100 %	0 %	0 %	0 %	307069359
126	NC_014495	T	7	7	6399	6405	0 %	100 %	0 %	0 %	307069359
127	NC_014495	T	6	6	6413	6418	0 %	100 %	0 %	0 %	307069359
128	NC_014495	TTC	2	6	6495	6500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069359
129	NC_014495	CCACT	2	10	6602	6611	20 %	20 %	0 %	60 %	307069359
130	NC_014495	T	6	6	6611	6616	0 %	100 %	0 %	0 %	307069359
131	NC_014495	T	6	6	6667	6672	0 %	100 %	0 %	0 %	307069359
132	NC_014495	ACAAAA	2	12	6688	6699	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	307069359
133	NC_014495	CAA	2	6	6743	6748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069359
134	NC_014495	GAA	2	6	6769	6774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069360
135	NC_014495	A	6	6	6788	6793	100 %	0 %	0 %	0 %	307069360
136	NC_014495	AAGA	2	8	6808	6815	75 %	0 %	25 %	0 %	307069360
137	NC_014495	A	7	7	6817	6823	100 %	0 %	0 %	0 %	307069360
138	NC_014495	CAAA	3	12	6829	6840	75 %	0 %	0 %	25 %	307069360
139	NC_014495	TTC	2	6	6842	6847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069360
140	NC_014495	TTATC	2	10	6863	6872	20 %	60 %	0 %	20 %	307069360
141	NC_014495	ATC	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069360
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144	NC_014495	GA	3	6	6950	6955	50 %	0 %	50 %	0 %	307069360
145	NC_014495	AAGT	2	8	7079	7086	50 %	25 %	25 %	0 %	307069360
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172	NC_014495	ACC	2	6	7763	7768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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174	NC_014495	ACC	2	6	7798	7803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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252	NC_014495	AAT	2	6	10503	10508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069365
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257	NC_014495	CAA	2	6	10751	10756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069365
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259	NC_014495	GAA	2	6	10927	10932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069365
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261	NC_014495	ATCC	2	8	11005	11012	25 %	25 %	0 %	50 %	307069365
262	NC_014495	TGA	2	6	11048	11053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069365
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267	NC_014495	GAT	2	6	11254	11259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069365
268	NC_014495	GAG	2	6	11290	11295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
269	NC_014495	T	7	7	11296	11302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_014495	AAT	2	6	11307	11312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_014495	T	8	8	11346	11353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_014495	GAA	3	9	11394	11402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069366
273	NC_014495	ATT	2	6	11411	11416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069366
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444	NC_014495	AT	3	6	19096	19101	50 %	50 %	0 %	0 %	307069376
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461	NC_014495	AAT	2	6	19469	19474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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